B病棟は、消化器外科、脳外科、心臓外科を中心とした外科系病棟です。手術や検査を目的とした赤ちゃんから学童期以降の子どもたちが過ごす急性期病棟です。スタッフ一同、手術前後で緊張や不安を抱えやすい患者さん・ご家族が安全・安心・安楽に過ごせるケアを提供するよう努めています。学童期の場合は、入院中も学習を継続できるよう養護学校と連携をとっています。乳幼児期の子どもたちは保育士とプレイルームでお遊びすることもできます。また、手術によって在宅での医療ケアが必要となる場合（経管栄養・吸引・ストマ造設等）には生活指導を看護師・医師・皮膚排泄ケア認定看護師・地域連携課と協働し入院中から退院までの支援をしています